O jogo tem lugar durante os eventos de Resident Evil 2, Resident Evil 3: Nemesis e Resident Evil Outbreak e está situado no seminário, cujos moradores se tornaram zumbis após um surto do vírus T, uma arma biológica ilegal desenvolvido pela Guarda-chuva farmacêutica empresa. A história é uma reinterpretação dos eventos descritos nos jogos originais, mudando certos eventos da série. Os jogadores assumem o papel de um serviço oficial Umbrella Segurança (USS), ou um membro da Força de Operações Especiais dos Estados Unidos. Ambos têm objetivos diferentes: Os membros da USS têm a tarefa de destruir provas de atividades ilegais da Umbrella, incluindo sobreviventes morte de brotos, enquanto a equipe de Operações Especiais tem de apresentar as ações da empresa. Operation Raccoon City vai permitir que o jogador a tomar decisões que possam ter repercussões significativas sobre o enredo da série, tais como causando a morte dos protagonistas de Resident Evil 2
